Nach dem tragischen Verlust seines besten Freundes macht sich ein trauernder junger Architekt auf die Suche nach seiner unbekannten Zwillingsschwester, die bereits als Embryo von ihrem Geschwisterchen getrennt worden ist.

Im Zentrum der Serie steht Sam, Angestellte eines international agierenden, privaten Spionagedienstes. Ihre Welt gerät ins Wanken, als ein Anschlag auf sie verübt wird.

James Howlett verfügt über die seltene Gabe, sich in Wolverine verwandeln zu können. Er ist nicht der einzige, in dem übermenschliche Kräfte stecken. Auch Victor Creed alias Sabretooth hat sie. Beide verbindet eine enge Beziehung, bis Wolverines Freundin durch Victor umkommt. Fortan ist er auf Rache aus und tritt dem Weapon X-Programm bei, um eine lebende Waffe zu werden. Dort lernt er weitere Mutanten kennen.