Vier kleine Schildkröten geraten in der Kanalisation von New York mit der geheimnisvollen Substanz Ooze in Berührung. Aus den Tieren wachsen daraufhin humanoide Mutanten heran, die durch ihren Meister Splinter, eine ebenfalls mutierte Ratte, in die Geheimnisse des Karate eingeführt werden. Seitdem kämpfen die vier Turtles für Gerechtigkeit auf den Straßen des Big Apples und leben und verstecken sich in der Kanalisation der Millionenmetropole. Eines Tages kommt ihnen durch Zufall die Reporterin

Der State Trooper Dan möchte sich seinen großen Traum erfüllen und einer K-9-Eliteeinheit beitreten, der Hundestaffel des Such- und Rettungsteams. Dafür schließt er sich mit einem anderen Außenseiter zusammen: der cleveren, aber frechen Tierheimhündin Ruby, die die Hoffnung auf ein neues Zuhause beinahe schon aufgegeben hatte. Die einzigartige Verbindung zwischen Mensch und Tier hilft ihnen, sich ihrer bislang größten Herausforderung zu stellen...